Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc2Q05020 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Apoc2Q05020 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Apoc2Q05020 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Apoc2Q05020 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Apoc2Q05020 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc2Q05020 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms