Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms