Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs2Q03350 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs2Q03350 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs2Q03350 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms