Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms