Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec23aQ01405 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sec23aQ01405 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sec23aQ01405 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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