Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms