Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smn1P97801 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smn1P97801 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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