Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H3f3aP84244 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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