Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms