Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms