Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lsm6P62313 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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