Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl27P61358 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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