Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P58686 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P58686 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P58686 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms