Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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