Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TesP47226 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TesP47226 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TesP47226 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms