Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ItgavP43406 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms