Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Mmp9P41245 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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