Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TtlP38585 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtlP38585 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtlP38585 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtlP38585 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms