Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc11P31313 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc11P31313 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc11P31313 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxc11P31313 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc11P31313 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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