Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc10P31257 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms