Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms