Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P18528 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms