Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18525 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18525 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18525 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18525 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms