Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms