Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms