Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms