Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nr4a1P12813 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms