Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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