Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01679 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01679 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01679 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms