Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl20O89093 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl20O89093 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl20O89093 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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