Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Foxq1O70220 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms