Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms