Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trdmt1O55055 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trdmt1O55055 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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