Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sp100O35892 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sp100O35892 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sp100O35892 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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