Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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