Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dgcr6O35347 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dgcr6O35347 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms