Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Kpna6O35345 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Kpna6O35345 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms