Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Q1O19441 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms