Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hps1O08983 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hps1O08983 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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