Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms