Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms