Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim18J3QNP2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms