Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms