Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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