Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms