Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8005F6YKY3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms