Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmgcF6VRN1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms