Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gcn1E9PVA8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gcn1E9PVA8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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