Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rrn3B2RS91 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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