Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC035947B2RQY6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms